ローカルアプリ上のWF（ワークフロー）表示については、基本的には全体のワークフローが表示される仕様となっており、任意に部署・ユーザー単位で表示制御を行う機能は提供されていません。
一方で、部署管理者配下のユーザーとしてアプリをご利用いただく場合は、当該部署に紐づくワークフローのみが表示されます。
そのため、運用面での対応としては以下を推奨しております。
・ワークフロー名に部署名
・用途を含めた命名ルールの設計
例：営業部_請求書_田中、経理部_領収書_佐藤
・利用ユーザーごとに対象ワークフローを明確化した運用設計
なお、本件につきましては、より柔軟な制御が可能となるよう、今後の機能改善に向けたご要望として社内へフィードバックさせていただきます。